
单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗原动物群特喜欢的人、寡核苷酸遮盖成本价高价或操作步骤注意事项比较复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导销售团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低代价、跨种类、全品台兼容的全新解决方案。
杂志期刊简价
Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内学科院基因遗传规律病的病与健康发育动物学理论科研院和国内基因遗传规律病的病学着主办单位的全国学术交流钻研刊物,着力推进于消息生命值学科和生态学学基因遗传规律病的病学行业邻域的原创网性理论钻研优秀成果。JGG 2026年度决定细胞7.1,Scopus学术交流钻研刊物评论统计指标CiteScore 9.9,稳居JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY行业邻域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY行业邻域Q1区,稳居国内学科院刊物分离动物学大类目1区(Top刊物),基因遗传规律病的病学和生态学化学与原子动物学小类双1区。BIOPROFILE
是那么到底怎样的才是HEATag
委婉的“二三合一”设定
HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成的融入血清
「定位功能器」方案 - 凝集素
能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化掩盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。
「无线射频连接器」控制模块 - HUH内切酶
可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)目录长条码采取共价接触。
“1+1>2”的效率:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品标签与朔源。
Fig1: HEATag几斤标签道理表示图
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实战经验检验员
HEATag真不知道有可以打?
是可以在有所不同前提条件下,进行蒲乳期猎物生殖人体细胞系单生殖人体细胞混样测序
实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。研究探讨团队合作为 HEATag 软件设置了多轮 “负压測試”,从血组织系到血组织核,从干燥到冷藏,从新鲜范本到确定范本,全方面验证通过它的稳定的性和靠普性。
第二轮检测重要性乳期食草动物内部系:探讨员首选了存在人、鼠、仓鼠三大种群的四种方式内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在恒温下能 HEATag 标记符号后交织测序。终结环保再生资源回收的 11447 个内部中,85.66% 都能经过 HEATag 长长商品条形码查询准确度符合到原种群,模板间交叉重合环境污染非常少,UMAP 聚类探讨法探讨更要会直接证明文件,HEATag 长长商品条形码查询与种群炎症因子聊天染色体组共同点相对高度同一。 接下来,测试方法前提经济條件进那步升级成:科研员去尝试在 4℃下标识鲜活上皮細胞、在室内温度下标识甲醇比较一定上皮細胞,有的单独标识上皮細胞核。会导致照样鲜亮:所以前提经济條件下,样表标价签与鱼类数据信息均享有良好 的相关性分析,分割更准率超 95%。即使甲醇比较一定会会导致略微的转录本是交叉水污染,上皮細胞核配制出现大量 RNA 泄露,上皮細胞内型的参考文献标注会导致照样与鲜活样表恢复不对,證明 HEATag 就可以标识有所差异补救前提经济條件下的实践样表。
Fig2: HEATag 可在各种不同状况下成功完成单组织转录组混样介绍
就能够标出哺乳期间绿色和浅海无脊椎神经绿色的原代肿瘤细胞
如果你说癌细胞核系测评是 “知识基础题”,那集体模板量可是 “浮动题”, 等模板量常常因癌细胞核款式复杂化、条件改变性比较特殊,被选为记号的技术的 “困惑”,而 HEATag 恰恰舞在等 “困惑” 上能够了优劣势。研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组识,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅能能被正确分,其他首要細胞类行的聚类算法没想到都清晰度可辨。
更令人惊喜的是HEATag对海域生态学的兼容性测试性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条状码与种类转录组具较高完全关联性,不会有发生因高盐环境会造成的 “记号就失效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。
Fig3: HEATag 可达成喂乳两栖动物安排样板诸多 scRNA-seq 介绍
Fig4: HEATag可实现目标刚采大海无脊椎骨各种动物多方面 scRNA-seq 研究分析
HEATag与肿瘤细胞的切合并不会影响转录组的明显发生变化
对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完整标记符号人物的同一,都不会对后期的的转录混合物析引起要素,保护了深入分析数据库的真识性。
Fig5: HEATag不用会影响样品的 RNA 表现传统模式
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素可期
HEATag 能为单神经细胞探究提供甚么?
HEATag 的價值,远不绝于 “处理好图标故障 ”,它的轻松性和共通性,未能为单細胞探究打开微信太多很有几率比
从应用软件场景设计来看看
HEATag 能遍布从 “容易是比较介绍”(如癌组织安排发展安排与合适组织安排发展安排、肿瘤药物操作与比对)到 “大占比实验分析”(如组织安排发展安排生殖内部图谱编写、mtk量意愿)的全范围之内意愿。伴随 PIP-seq、Stereo-cell 等新颖可延伸技术水平的经济发展,HEATag 还能进一步的一个脚印增强单生殖内部实验分析的通量,力助科技研究拜谱生物发展较大占比的内容。从跨前沿技术竞争力来谈
HEATag 往往常用作转录组学,还能与表观基因组组学、淀粉酶质组学、地方组学等工艺水平配合,能够 全屋定制数据库索引和寡核苷酸队列,HEATag 能能快速融进了 各个的组学程序流程,不危害卫星信号捉捕深层。也,基本概念HEATag还能能成长 单细胞核糖组学科研工艺水平。BIOPROFILE
合伙日常动态
拜谱生物工程与陈凯客座教授促成初始合伙相关
值得购买观注的是,在 HEATag 新技艺水平展示出硕大应该用空间的游戏 背景下,拜谱海底海洋生物工程已与杭州地区海底实践与工程建筑杭州实践室(杭州)陈凯教受实现目标分式的运算公司合作有意向的客户。双方彼此打算环绕 HEATag 新技艺水平的企业化立式、成果转化的工作转化率等导向呈现宽度分工协作,持续推进哪一高产出费用、跨植物物种的单组织组织細胞标识新技艺水平更加快应该用于合理成果转化的工作的场景,为大量实践室供给高效、性价比最高、经济增长的单组织组织細胞探索软件工具,推动成果转化的工作的工著者在组织组织細胞海底海洋生物工程学、海底海底海洋生物工程学、病系统等科技领域具有大量提升