在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

的研究后果

1、从光敏培养出来组织中提炼DNA交连蛋白酶质

为剥离光交连淀粉酶质-DNA分手后复合物使用LC-MS了解，创作者制作打了个种性质发生变化纯化方案范文，可从DNA中避开非说交连淀粉酶质，仅在影响时可以采用就直接遗传基因组交往聚集DNA交连淀粉酶质。用TRIZOL领取染色的质并避开入狱获的非交连淀粉酶，之后将其再次溶解完以参与RNase助肠蠕动。可以采用超声清洗裁取得到的淀粉酶质交连DNA的领取物，在硫氰酸胍中加热性质发生变化，并在二钝化硅离心分离柱上巨烈洗洁以避开非说交连淀粉酶质一直到进行。可以采用核酸酶处里从DNA中放出光交连淀粉酶，并参与胰淀粉酶酶助肠蠕动使用LC-MS了解。该的方式被命名为淀粉酶质交连DNA领取或XDNAX。

图1.蛋白酶质热塑DNA添加或XDNAX方案图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可之间接触的面积DNA的血清质图谱

将光化学交联办法选用于MCF7神经细胞膜，察觉了1,805种侯选人脂肪酸质，在这当中1,191种存在着于3个或很多次去重复中。60%的DNA互不效果组有点核酸相通过的GO批注，在贫乏核酸相通过批注的脂肪酸质质中，极大的功劳出自核纤层脂肪酸质，一方面是操作复染质结构和神经细胞膜分化的脂肪酸质质（图2）。

图2 . 可随时接觸 DNA 的球胆固醇（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3归纳了DNA相护角色组所抽象性的蛋清质-DNA画质基本包函的核苷酸交连肽。这分为是根据（1）球状DNA相配合起来结构的域、（2）DNA 相配合起来周期性区（IDR）和（3）是根据与某个蛋清质（这类组蛋清相配合起来蛋清）、RNA（这类剪接成分）或相离心分离区室（这类核仁蛋清）相护角色而形成的环镜亲近。

图3 . 可立即触及 DNA的结构的域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法细胞系扰动当天与DNA联系的转录要素

雌生长雌性的激素营养素激酶α（ESR1）驻在胞质溶胶中，有一天遇着其配体，触及易位到组织受损体细胞结构，在那它与遗传基因组中的其他地方依照以激起其他的转录系统程序。将血清饥饿的MCF7组织受损体细胞爆出于高含水量雌生长雌性的激素（10 nM 17β-雌二醇）4两多分钟，与虚拟仿真治理 的较好组织受损体细胞较好这句话的DNA之间效应组（图4A）。其中的，雌生长雌性的激素激起后DNA之间效应组中的ESR1延长了30倍（图4B）。总的来看，在1,814个按量的营养素质-DNA之间效应中，约有9%现示出大于2倍的重要变化规律，并分析到与ESR1兼具之间效应的营养素如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌抗生素正确处理乳线癌細胞 DNA 之间用组的酶联免疫法相对（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

研发进来着色体组的血清质以知晓它是怎么样被导出并付诸活动的，向来是科学学习师某个继续的追求理想。着色体组可及性关键以DNA为学校的度角做出研发，其实，到如今就行，着色质凝胶的用处中的哪类血清质与DNA 发生机械上下级用处尚不弄清楚。操作零间隔光热塑，可察觉到DNA上下级用处组中的一般数血清质，XDNAX技術将身为血清质-DNA上下级用处研发的庞大软件工具。

拜谱个人总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的蛋白酶质组学、遮盖组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

分类期刊论文：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.